낫토도 썩습니다.
발효하고 있는 식품입니다만, 부패는 합니다.
유통 기한이 만료된 낫토는 서서히 실에 끈기가 없어져 곧 끊어지게 됩니다.
더욱 진행하면 실이 당기지 않게 되어 탄 듯한 암모니아 냄새가 납니다.
외형은 콩이 검게 되어 녹은 상태가 됩니다.
이때 먹어도 몸에 해는 없다고 합니다만, 쓴맛·신맛이 매우 강하다고 합니다.